Seit vielen Jahren ist Karl von Habsburg Mitglied in den verschiedenen Verbindungen des akademischen Bundes katholisch-österreichischen Landsmannschaften, eines Verbandes von Studentenverbindungen, der sich seit seiner Gründung immer zum Haus Österreich bekannt hat, und dem auch viele andere Mitglieder der Familie angehörten und angehören. So ist unter anderem seit dem November 2015 auch Ferdinand von Habsburg Mitglied fast aller dieser Verbindungen.

Im November 2002 hat Karl von Habsburg die Position des Obersten Bandinhabers von seinem Vater Otto
von Habsburg übernommen, eine Ehrenposition, die an den Souverän des Ordens vom Goldenen Vlies geknüpft ist und die besondere persönliche Bindung dieser Studentenverbindungen an den Chef des Hauses ausdrückt.

Der akademische Bund katholisch-österreichischer Landsmannschaften wurde 1933 gegründet und besteht derzeit aus zehn farbentragenden Verbindungen in allen großen österreichischen Universitätsstädten. Seine Corporationen wurden im bewussten Gegensatz zur der in der Zeit nach 1918 vorhandenen Deutschtümelei an den Universitäten gegründet; so kamen von Anbeginn an Mitglieder dieser Studentenverbindungen aus allen Teilen des alten Österreichs und war und ist auch heute noch das Prinzip der Vaterlandsliebe im Gegensatz zu anderen katholischen Studentenverbindungen bewusst nicht an die Grenzen des heutigen Österreichs geknüpft; ebenso stellt das Bekenntnis zum Haus Österreich ein wesentliches Wesensmerkmal dar.

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